農政課
水田・畜産振興係
水田（米、麦、大豆）振興、生産調整、集落営農、農用地利用集積促進、遊休農地対策、畜産振興に関すること。日本型直接支払制度、人・農地プランの作成、佐伯市農業振興計画、佐伯市農業再生協議会に関すること。各種団体の育成及び支援、財産の管理に関すること。部内の公の施設指定管理者選定委員会に関すること。
園芸振興係
園芸（野菜、花き、果樹）振興、茶業振興に関すること。直販所、加工所の指導・助言に関すること。新規就農支援、認定農業者の育成及び支援、農業経営基盤強化促進基本構想に関すること。農業流動化推進、農業振興地域整備計画、農業振興地域整備促進協議会の事務、農業技術者協議会の事務に関すること。農業青年組織、農村女性組織、財産の管理に関すること。地方卸売市場佐伯青果市場に関すること。農産物の流通に関すること。課の庶務に関すること。
有機農業推進係
有機農業の推進に関すること。環境保全型農業の推進に関すること。市民ふれあい農園の管理運営に関すること。
農業工務係
土地改良事業、農業農村整備事業、農道整備、かんがい排水（農業用排水路）、農業用施設の維持管理に関すること。農地防災事業、農地及び農業用施設災害復旧事業、用地の買収及び支障物件の交渉に関すること。各種団体の補助、各種届出及び許可事務、財産の管理に関すること。 ため池に関すること。
林業課
林業振興係
佐伯市森林整備計画等の策定及び森林法に関すること。市有林の管理、鳥獣保護・狩猟、特用林産物、環境緑化推進事業（緑の募金等）、財産の管理、有害鳥獣被害防止、各種団体の補助、各種届出・許可事務に関すること。 森林環境譲与税に関すること。林産物の流通に関すること。山林作業道に関すること。課の庶務に関すること。
林業工務係
林道事業の設計・施工、林道事業の計画（総合計画等）、林道災害復旧事業、林道・作業道の維持管理、治山事業の設計・施工、用地の買収及び支障物件の交渉、財産の管理に関すること。
水産課
水産振興係
漁場の計画（総合計画等）、調査、管理及び監督に関すること。漁業者への経営指導及び資金融資に関すること。水産資源の保護、栽培漁業、水産物の流通、漁業施設の調査及び計画、水産関係団体、水産行政の企画調整に関すること。公害・赤潮被害の防止対策及び救済制度に関すること。各種団体の補助、財産管理、各種届け出、許可事務、水産加工業との連携に関すること。佐伯市公設水産地方卸売市場に関すること。漁港及び漁港海岸の漂着物に関すること。放置艇対策に関すること。課の庶務に関すること。
水産工務係
漁港事業及び漁港海岸事業の計画、設計、施工に関すること。漁港施設及び漁港海岸施設の維持管理、災害復旧事業に関すること。漁港・漁港海岸関係の調査に関すること。漁業集落内の整備、漁港区域内の公有水面埋立申請、財産の管理に関すること。
地籍調査室
地籍調査係
地籍調査の基本計画及び実施に関すること。地籍簿及び地籍図の作成に関すること。地図情報システムの維持管理に関すること。