営業課
料金係
水道事業、飲料水供給事業、下水道事業、農業集落排水事業、漁業集落排水事業、小規模集合排水事業、合併処理浄化槽設置事業及び市町村型浄化槽整備事業に係る事務、料金等に関すること。
庶務係
水道事業、飲料水供給事業、下水道事業、農業集落排水事業及び漁業集落排水事業に係る事務、予算・決算等に関すること。
水道課
水道工務係
水道事業の新設及び改良、飲料水供給事業の新設及び改良に関すること。
水道維持管理係
水道関係の維持管理、給水装置の修繕、水質、水道施設の運営及び管理に関すること。指定給水工事業者の許可及び指導、給水台帳の管理、水道加入金、量水器の管理、簡易専用水道及び小規模簡易専用水道に関すること。
下水道課
下水道工務係
下水道事業、特定環境保全公共下水道事業、農業集落排水事業、漁業集落排水事業及び浄化槽設置事業（市町村型）に係る事務。
（新設及び改良に関すること。道路占用許可申請に関すること。）
下水道業務・維持管理係
下水道事業、特定環境保全公共下水道事業、農業集落排水事業、漁業集落排水事業及び浄化槽設置事業（市町村型）に係る事務。
（生活排水処理基本計画、排水設備工事店の認可及び指導、加入促進の企画調整及び受益者負担に関すること。）
下水道事業に係る事務。（汚水管の維持管理、佐伯市終末処理場の運営及び維持管理、特定環境保全公共下水道事業の処理場の運営及び維持管理、農業集落排水事業の処理場の運営及び維持管理、漁業集落排水事業の処理場の運営及び維持管理に関すること。）